ルビを振った文書の中に半角のスペースが入ってしまうと起こる現象です。半角スペースを交えた文書でなければ、読込時に発生しません。再設定することで直りますが、なるべく気をつけたいところです。
これには自分も参りました。縦書きテキストボックスではほとんど対応していません。読み込める時もあるのですが、日本独特の縦書きは欧米文化では理解しがたいということでしょうか？ここはきつくフィードバックする予定です。頼みます。
Microsoft Wordの文書を読み込むとせっかくオプションで設定した「既定のフォント」が勝手に変更されてしまうバグが報告されています。これは、Wordファイル内で指定されている欧文フォント、日本語フォントが両方変更されてしまいます。
欧文フォントは、Centuryになってしまいフォントの置換をしていないと文字化けを起こします。これは、OpenOffice.orgが、欧文フォントで日本語を読もうとするためです。また、日本語フォントはHelvatica等に変わってしまうようです。解決法は現在ありません。Wordの側で意識的にフォントを指定している時はこれほどにまでもなりませんが、それはそれで問題です。
これについては、フィードバックいたしました。